Берега Тисы с давних времён манили людей, и первые сельские общины здесь появились в начале бронзового века, порядка пяти тысяч лет назад. Город заложили значительно позже, при римлянах — Партискум стал важным пунктом на дороге, связывающей провинции Паннония и Дакия. Римский гарнизон тогда присматривал за торговлю солью и золотом.
Пришедшие в эти места венгры сразу оценили богатую природу и наличие судоходной реки. К концу XII века, когда название Сегед начинает мелькать на страницах исторических документов, его жители уже полным ходом наживались на обслуживании судов и продаже соли. В середине следующего столетия стратегически важному поселению были дарованы права города, тогда же на холме над Тисой появился хорошо укреплённый замок.
К началу эпохи турецкого владычества Сегед считался одним из самых богатых мест Венгрии. Вторжение войск Османской империи положило его процветанию конец: в 1526 году турки захватили город и разграбили его подчистую. Следующие 160 лет Сегед находился под властью захватчиков. Правда, горожанам повезло в том плане, что их родину сделали столицей турецких владений, и это значительно облегчило им жизнь.
После освобождения город долго не мог достичь прежнего уровня процветания, только к середине XVIII века экономику вновь удалось наладить. А в 1879 году произошло страшное наводнение, когда Тиса вышла из берегов и смыла 95 процентов домов Сегеда. При таком масштабе разрушений воссоздавать историческую застройку не было смысла, и было решено полностью преобразовать центральные кварталы. Реконструкция началась в 1880 году по заранее разработанному плану, за следующие 4 года место старых домов и извилистых улиц заняли широкие проспекты и запоминающиеся архитектурные ансамбли. Современный Сегед справедливо считается одним из красивейших городов Венгрии.