Простите, но информация о том, "как удобнее всего добраться из аэропорта в отель Mala Strana", причём, на русском языке, размещена на странице этого отеля
http://www.garzottohotels.cz/..."Из аэропорта Вацлава Гавла можно добраться на 119 автобусе до станции метро Nadrazi Veleslavin. Затем надо перейти в метро Nadrazi Veleslavin на линию А и ехать до станции метро Malostranská. Затем пересядьте на трамвай 22, 12 или 20 ехать до остановки Újezd. Выйдя из трамвая идите по улице Újezd в противоположную сторону от Пражского Града и на втором перекрестке поверните налево на улицу Mělnická. Отель находится на правой стороне около 3 минут пешком от трамвайной остановки".
От себя добавлю, что на всю поездку нужен 1 (ОДИН) обычный (základní) билет за 32 Kč. Все виды билетов в Праге действительны на фуникулёр, поскольку это часть транспортной системы города.
----
Нужен Вам билет на три дня, или нет - решать Вам. Что же касается билетов на "красный двухэтажный экскурсионный автобус", то их можно купить в Интернете за 500 Kč на 24 часа. Имхо, пустая трата денег. Лучше заплатить вдвое больше и (у них же) купить русскоязычный тур в Вену, Чески-Крумлов, Карловы-Вары или Карлштайн.